Verheiratet war Protzner mit Dr. Maria Seifert-Protzner, der langjährigen Wirsberger Ärztin. Als seine Frau schwer krank wurde, hat er sie liebevoll gepflegt bis zu ihrem Tod vor fast genau zwei Jahren.
Wolfgang Protzner war mehr als 40 Jahre Stadtrat in Kulmbach, er war zweiter Bürgermeister unter Erich Stammberger, war Mitglied des Kreistags. Er war lange Zeit der Studienleiter der Akademie für Neue Medien, hat sie aufgebaut und bekannt gemacht.
Er war einer der Hauptakteure, die 1973, noch lang vor dem Fall des Eisernen Vorhangs, die Städtepartnerschaft mit Saalfeld anbahnten, und nicht zuletzt hat er auch eine tragende Rolle gespielt, als es galt, die Bedeutung der Basilika in Marienweiher zu stärken.
Protzners Bruder Bernd, ehemaliger CSU-Generalsekretär und Kulmbacher Bundestagsabgeordneter, war bereits 2018 gestorben.